სახელმწიფო აუდიტის სამსახურმა ჩაატარა „რეგიონული მართვის საკითხებში აფხაზეთის მინისტრის აპარატი“ 2011 წლის 1 იანვრიდან 2014 წლის 1 იანვრამდე პერიოდის ფინანსური და შესაბამისობის აუდიტი. ჩატარებულ აუდიტთან დაკავშირებით შედგა აუდიტის ანგარიშები, რომელებშიც გამოითქვა პირობითი მოსაზრებები ფინანსური ანგარიშგების შესახებ და კანონმდებლობასთნ შესაბამისობის შესახებ.
ჩატარებული ფინანსური აუდიტის შედეგად გამოვლინდა, რომ 2011 წლის 31 დეკემბრის, 2012 წლის 31 დეკემბრის, 2013 წლის 31 დეკემბრის, მდგომარეობით ორგანიზაციას არასწორად და არასრულად ჰქონდა წარდგენილი ფინანსური ანგარიშგების შემადგენელი ფორმა N1, ფორმა N2, ფორმა N3 და ფორმა N5 კერძოდ:
